临床症状主要包括上腹痛，腹胀，早饱，嗳气，厌食，烧心，反酸，恶心和呕吐，病程多在2年内，症状可反复发作，也可在相当一段时间内无症状，可以某一症状为主，也可有多个症状的叠加，多数难以明确引起或加重病情的诱因。
功能性消化不良的病因不明，目前认为是多种因素综合作用的结果，这些因素包括了饮食和环境，胃酸分泌，幽门螺旋杆菌感染，消化道运动功能异常，心理因素以及一些其他胃肠功能紊乱性疾病，如胃食管反流性疾病(GERD)，吞气症，肠易激综合征等。饮食与环境因素
功能性消化不良病人的症状往往与饮食有关，许多患者常常主诉一些含气饮料，咖啡，柠檬或其他水果以及油炸类食物会加重消化不良，虽然双盲法食物诱发试验对食物诱因的意义提出了质疑，但许多患儿仍在避免上述食物并平衡了膳食结构后感到症状有所减轻。
消化不良性腹泻或者肠炎.需要进一步化验大便常规确诊，需要看看是不是有白细胞，如果肠炎可以服用头孢克污混悬剂或者黄连素片治疗，大便常规正常的情况下建议服用妈咪爱和思密达治疗.需要避免受凉和生冷食物.
由于孩子正处于快速的生长发育阶段，孩子的消化能力和孩子对营养的需求量不成正比，往往会导致消化不良症，首先让孩子的饮食有规律并且符合她的体质。确保每顿饭适量不至于太多，确保食物不会含太多脂肪太过于油腻。
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