一、胎儿心脏某部分发育到较低的阶段即停止，或由于发育的过程中发生了轴转的错误，如大血管易位。
二、小儿出生后，仍长期留存一部分胎儿期所需要的特殊心血管通路，如动脉导管未闭等。
三、母亲的疾病往往影响胎儿发育，母亲在妊娠最初3个月内被病毒感染，尤其是风疹病毒，则小儿易发生心脏畸形。
四、母亲在怀孕期间吃了某些药物，也可以导致胎儿心脏畸形。
五、某些可导致先天性心脏病的遗传因素。
预防
1、在怀孕早期(3个月之前)尽量别在电脑前、微波炉等磁场强的地方坐太长时间，因这时的胎儿还不稳定，各个器官还正在成形阶段，很可能造成孩子先天性心脏病。
2、不要接触宠物，因宠物身上的细菌及微生物也可能造成孩子先天性心脏病。
3、应注意母亲妊娠期特别是在妊娠早期保健，如积极预防风疹、流行性感冒、腮腺炎等病毒感染。避免接触放射线及一些有害物质。在医生指导下用药。注意膳食合理，避免营养缺乏。防止胎儿周围局部的机械性压迫。
想要预防孩子出现先天性的心脏病，就要在怀孕期间远离一些不良因素，避免这种情况的发生。在孕期要注意定期产检，当发现问题的时候，根据医生的建议决定孩子的保留问题。当发现孩子有先心病的时候，一定要注意及时的治疗。
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