孕早期和孕中期高热对宝宝的危害最大，会损害胚胎的正常发育，特别是中枢神经系统，干扰胎儿器官的正常分化和发育，有可能引起胎儿畸形或死亡。这是因为在高温环境下，物理性有害因子会杀死早期胚胎中正处于分裂中的细胞，使该组织停止发育，造成畸胎，严重的可致胚胎死亡。其中高热对脑组织的危害最为明显，体温升高1.5摄氏度，胎儿脑组织就停止发育，若升高3摄氏度，则可造成脑细胞死亡，从而导致胎儿出生后智力低下，学习记忆力和反应能力差。
最新的研究还发现，孕妈妈发热可以加强其他致畸原，如砷化钠、维生素A的致畸作用。人们现在认为，在世界性流感流行期间和随后一段时间内，先天性畸形发生率升高的主要原因不是流感病毒对胎儿造成的直接危害，而是孕妈妈患流感后发热引起的结果。
孕妈妈一般抵抗力较弱，容易感染病毒，为了减少出生先天性畸形儿，尤其是无脑儿、脑积水、小头畸形这类中枢神经系统畸形儿，孕妈妈在孕早期应注意避免感染各种发热性疾病，不接触发热患者包括患儿，不去拥挤的环境或空气不洁的公共场所，应多注意冷暖，随时加减衣服，平时适当运动、注意营养和休息、勿过劳、居室注意通风。若出现发热，体温超过39摄氏度时，应立刻采取快速物理降温。如用温毛巾反复擦身，在腋窝、额部和腹股沟部放置冰袋等。一旦发生长时间高热需征求医生意见决定是否继续妊娠，并尽快对症治疗。尤其需要注意的是，孕妈妈切勿自己盲目用药或滥用药物，特别是链霉素、庆大霉素等副作用。