首先通过病史、体格和化验检查，根据详细的资料和化验结果，综合分析，判断引起儿童矮小的原因，最后确定治疗原则。原因不同，处理方法也不同：
1、营养不足：应合理营养、全面均衡饮食，培养良好的饮食习惯，促进食欲等。
2、全身疾病引起的矮小：应积极治疗原发疾病。
3、家族性矮小和体质性生长发育迟缓：通过各种调养，充分发挥生长潜力，可酌情使用生长激素。
4、精神因素引起：改善生活环境，使儿童得到精神上的安慰和生活上的照顾
5、先天性遗传、代谢性疾病：根据情况进行特殊治疗。
6、甲低、垂体性侏儒、先天性卵巢发育不全、小于胎龄儿、特发性矮小等应对症治疗。
生长发育迟缓表现往往是多方面的多有体格发育、运动发育及智力发育落后但也可以某一方面为突出表现。如果身高、体重、头围的测量值全部都偏低的话那就表示孩子的发育出现了全面的迟缓，应该向小儿科医师做详细咨询，以确认是否需要做进一步的检查。如果只是身高、体重、头围的某一项指标出现偏低，那就表示孩子可能出现了部分的发育迟缓，可进一步检查脑神经或内分泌等项目以了解孩子的生理发展是否受到了影响。