1、对小儿生命安全有潜在危害的畸形应早期手术。例如动脉导管未闭，本来可在一岁以后手术，但其中屡次并发肺炎、心力衰竭者，则需及早手术。
2、某些畸形对身体功能影响甚微，可以不治疗，如轻度的皋丸鞘膜积液等。
3、有些畸形随小儿年龄增长，病情可能有改善或自愈，且畸形对身休机能的影响也不大，手术可推迟。例如脐庙，往在在一、两岁内自愈。所以，两岁以后的病儿脐病仍未痊愈时，方考虑手术治疗。
4、在保证安全前提下，需要手术治疗的畸形，尽可能一次手术解决问题，但目前有些畸形尚需分期手术才能根治。
5、多发畸形者，先治疗对身体机能影响较大的畸形。
总之，对有畸形的小儿，要详细分析其病情，在医生的指导下，争取最满意的疗效。事实上很多畸形儿经医生治疗后达到健康人的标准。各种畸形手术适宜年龄请参阅本章末的附表。
第二方面，即生过一个畸形儿后，母亲再生第二个小孩时，会不会还可能出现畸形呢?这是当前正在研究的课题。医学上把再生子女时可能出现畸形的机会称作复发危险率，复发危险率高则再生小孩时畸胎机会也越大，差不多每种畸形都有复发危险串，虽然它作为一种机率，对每一对夫妇来讲有很大差异，但可以作为参考依据。一般讲，复发危险率与遗传因素关系密切，这方面的知识可向当地有关单位进行遗传咨询。
此外，为减少再生畸胎的机会，还要注意环境因素对妊娠的影响，例如妊娠早期感染、盲目服药、接触放射线、营养缺乏等，再次妊娠时就要予以避免。
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