化学实验室存在许多安全隐患如：各空间的布局、设备的用电、操作中的通风、对高要求药品的储备、对过期药品及废弃物的保管、处理措施等等。
化学实验室常见的危害包括：
（1)实验人员在实验的过程中对药品、容器的不熟悉，致使在配制的过程中操作不当，使得反应加剧而无法控制；
（2)恶劣的天气如洪水、雷电等自然灾害引起化学品的泄漏，发生化学反应等；
（3)在多数的化学合成实验中，药物之间会发生剧烈的反应，如遇强腐蚀性的药品或强碱、强酸性试剂易溅出，腐蚀到人体的皮肤甚至器官；
（4))物药品的强腐蚀性易造成盛放的容器老化、故障，造成危险品的泄漏，造成人身安全和环境的破坏。
（5)实验室自身的条件简陋，空间小，不能有效划分安全区域。当化学药品不能做到百分百密封时，气体相互接触反应，当达到某个燃点时易引发火灾或爆炸；
（6)实验室内的供电线路和用电的器具易发生老化，发热或者短路产生的火光一旦接触燃点极低的药品时易引发火灾或爆炸；
不论是学校还是企业内部的化学实验室都建立有详尽的安全准则，虽然化学实验室存在很多危害因素，但如果采取相应的安全防护措施，实验室人员（学生）具有基本的安全常识和正确的操作方法，化学实验室会更加安全。
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