肠病毒在分类上属微小病毒（Picornaviridae）科，肠病毒属人类肠病毒种。包括小儿麻痹病毒三型、克沙奇A病毒23型、克沙奇B病毒6型、伊科病毒31型、肠病毒68-71型，共67种类型。由于这些病毒都栖息于人体消化道，在生化特性、流行病学及致病原因上也具有共同点而被归纳在一起。现在，小儿麻痹病毒已有疫苗可以预防，因此，现在的孩子不受到小儿麻痹病毒的威胁。流行在孩子中间的病毒就剩下克沙奇病毒、伊科病毒、肠病毒68-71型。
含单股核醣核酸的病毒，有超过60种以上不同的血清型，传统上，基于肠病毒在组织细胞中的复制与动物模式可分为小儿麻痹病毒、克沙奇A型病毒（coxsackievirus A）、克沙奇B型病毒、伊科病毒（ECHO virus）及不分型的肠病毒等。
近年来，肠病毒基于核?酸和氨基酸的序列，被重新分成小儿麻痹病毒与人类肠病毒A、B、C、D等五大类。新生儿受到肠病毒的感染导至重症，主要是非小儿麻痹病毒的肠病毒（non-polio enterovirus），以克沙奇B型病毒、伊科病毒为主，这些感染新生儿的肠病毒和今年台湾地区流行的肠病毒71型是分属于不同的血清型。
肠病毒引发的疾病十分广泛，不同型的病毒可能会有相同症状。典型的症状包括疱疹性咽峡炎、手足口病、无菌性脑膜炎。而心肌炎、心包膜炎、病毒性脑膜炎、肢体麻痹症候群是属于较严重的疾病。并不是所有受到肠病毒感染的人都会有症状，因免疫力不同，约50%～80%是无症状感染，有部分的人会有轻微类似感冒或肠胃炎症状。
无菌性脑膜炎
头痛、呕吐、颈部僵硬与疼痛，症状严重的需住院治疗。
疱疹性咽峡炎
口腔后部出现水泡很快破掉变成溃疡，平均2～12个，发烧约2～4天，口腔溃疡约7天左右恢复。鼓励孩子多喝水，如果有脱水现象就需要点滴注射。
手足口病
在舌头与颊黏膜有口腔溃疡，会有稍微鼓起的皮疹分布于四肢、臀部，常常有小水泡或是水泡破掉留下的小痂块。因为口腔溃疡，没有食欲，要鼓励孩子多喝水，以预防脱水。