一、红泥藻处理方法
1、提高水流速度，减少喂食，检查灯泡的使用寿命。
2、减少喂食，勤换水，避免添加剂
3、能看到红泥藻的地方，采用虹吸出来
4、用钢刷刷掉
5、把蛋分调得敏感些
6、及时清除过滤棉上附着的红泥藻或用抄网将水中飘动的红泥藻捞出
没有足够的灯光，红泥藻就会饿死。但是缸内养的珊瑚的话，就会有担忧。其实最简单的方式是关闭灯光3天。如果水族箱内以软珊瑚和鱼类为主，不必为光照周期担心的话就可以采用关灯的办法来去除红泥藻；如果水族箱内有LPS、海葵、五爪贝等生物，这种方法一样是安全的。如果有SPS，那么要考虑一下了。
喂食的时候，把附近房间的灯打开，可以给鱼的视线照明，喂食后几分钟再关闭。尝试关灯几天后，看到的水质也会变得比以前清澈，水族箱四壁上的藻类消失，底砂和活石上也看不到红泥的身影。蛋分需要每天清洗，特别是在第三天，因为这一天死亡细菌的输出是最多的。
去除红泥藻不能一时心急，得有一个循序渐进的过程，减少光照和喂食次数，让红泥藻内部的细菌饿死。
二、如何防治水族缸中的红泥藻
1、严格控制缸中有机污染物的产生
对于缸中鱼类的喂食必须要完全避免食物沉淀在缸底，要大量喂食珊瑚时必须有强大的过滤设备，随时清理食物残渣才行，未食用过的有机物（POM）所能溶解出的有机溶解物（DOM）是鱼类排泄物的好几倍，缸中如有生物如鱼类、珊瑚、微生物等死亡所产生的污染也相当高，这种高养分形式的有机污染物是红泥藻的最佳食物来源！单纯形式的氨基酸、维他命等添加物也是其食物来源！但是缸中不喂食所有生物都很难生存！因此循序提高喂食量，让缸中的菌种慢慢与喂食量能平衡，自然就不会有多余的食物留给红泥藻了，其他有机污染物的防治可参考海水缸中的有机物文中的说明。
2、适当光照
良好的照明是避免红泥藻泛滥的方式之一，根据科学研究在纯蓝光下，就算有养分红泥藻也会长的很慢，选择高色温灯管一般珊瑚大致上都还能生长良好，却能限制红泥藻的生长，视觉效果也很棒，可谓一举三得，如果在控制有机养分后，红泥藻依然活跃，暂时关闭灯光3~5天，可以阻断其生命周期，算是很有效的治疗法，如果养分未获控制，则熄灯期后依然会复发。
3、充分的水流
改善缸中的水流、避免水流的死角、避免沉积物出现在缸中任何地方，则缸中要出现红泥藻的机率就相当低了，除非有机污染物已经累积到相当多的程度。
4、有机碳源的供给
纯的有机碳原（DOC）的供给对红泥藻来说是加速有机氮（DON）被红泥藻吸收利用，添加后在相同的条件下，红泥藻的数量会爆增，就算光照不强依旧能在短时间内将DON吸收殆尽。有机碳原添加后再配合手动清除效果会更佳！
5、除红泥藻生物
红泥藻之所以能屹立35亿年，除了其超强的生命力外，本身会制造毒素与抗生素有很大的关系，这使得地球上能以这类生物为食物的生物相当的少，对其毒素不能免疫的生物如果误食经常会送命，根据一些国外的报导会吃红泥藻的生物包括极少数的红脚寄居蟹、某些食藻螺等，其实请生物去吃有毒的食物有点虐待动物的感觉，某些生物必须兼吃其他食物才能解毒，但是水族缸中并不一定会有这种解毒的食物，因此很多人经常买了这些生物都养不久就挂了。
6、吸除现有红泥藻
将缸中红泥藻在换水时以水管将其吸出缸外算是很有效的除红泥藻方式，但是要发挥最佳效果必须等红泥藻将缸中有机污染物吸收的差不多时比较容易见效，否则就要跟着大量换水，如果所换的水不够纯净，则效果会大打折扣。
7、使用抗生素药剂
抗生素能杀死红泥藻、但是红泥藻的孢子并不易被消灭！如果环境不变，使用过后通常会复发，且会更严重，因为缸中被杀死的生物都会重新成为红泥藻的食物来源。
8、加强过滤设备
将蛋白调得很湿、使用活性碳、沸石等都有助于防止泥藻的产生，如果缸子的泥藻已经爆发的相当严重，此时除了大量换入纯净的水外，添加有机吸附剂、吸附棉等可以发挥较大的功效。
9、培养能大量吸收有机溶解物的生物
像软珊瑚、海绵、贝类等。
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