与低婚检率此相对的，却是参加婚检人群中婚检疾病检出率竟高达20%，也就是说，5对前来婚检的新人就有一对被检出异常。
一医院婚检异常检出率高达69%市妇婴医院妇女保健科是全市免费婚检的医学指导机构，从去年4月份广州在全市推行免费婚检以来，一直关注着来自各区(县级市)上报的婚检相关数据。科长于佳介绍，全市推行免费婚检一年半以来，婚检疾病检出率维持在20%左右，该数据远高于全国的其他省份!摘取何贤医院在实施免费婚检的第一个月的数据，当月到何贤医院进行免费婚检者173例，检出异常情况119例，异常情况检出率高达69%。
接受检查的男性为86人，女性为87人。在异常情况具体分布中，其中男性检出56例，检出率为65%，女性检出63例，检出率为72%;按疾病检出的数据来看，27例患病，疾病检出率为16%。异常情况主要是乙肝表面抗原阳性及地中海贫血筛查异常。广州地贫检出率维持在5%在医生们看来，从优生秀育角度出发，婚检是“非常有必要的”。
于佳指出，“地中海贫血是广州地区高发的地方性遗传病，根据今年6月份最新的统计数据，全市参加免费婚检的新人中，地贫的检出率维持在5%。通过规范高效的婚前保健服务和围产保健服务，可使广州每年减少相当数量的出生缺陷婴儿和200名左右重度地中海贫血患儿的出生。”
此外，G6PD缺乏症(蚕豆病)筛查、HIV(艾滋病)都是广州婚检中指定加入的检查项目，外省很多地区并没有设这两个项目，因此也是广州婚检疾病检出率较高的原因之一。而从发病情况来看，男女性主要是生殖系统疾病。生殖系统疾病是与婚育直接相关的疾病，男性主要是包皮过长、包茎、索静脉曲张等。女性主要是生殖道感染，严重的可引起盆腔炎，甚至不孕，婚后可引起交叉感染。