怀孕第4个月起，食物通过准妈妈胃肠道的时间明显延长。通过时间常受血中激素的调控。孕酮使胃肠蠕动变慢，通过时间延长;胃动素则相反，它使胃肠道蠕动加快——通过时间缩短。怀孕后血中孕酮增加近80倍以上，胃动素的含量却下降，致使胃肠道蠕动慢，食物通过胃时间长，自然容易发生便秘。
活动过少也是一个原因。许多女性怀孕后，唯恐活动会伤了胎气，加上家人的特别“关照”，往往活动减少，整天坐着或躺着，使得蠕动本已减少的胃肠对食物的消化能力下降，加重腹胀和便秘的发生。
一些器质性病变也会导致准妈妈便秘，比如，一些准妈妈出现痔疮、肛裂等直肠疾病，或者说原本就有这类疾病的话，一旦发病却又未能及时治疗，到了孕期就很容易使病情加重，这些都会增加准妈妈患便秘的几率。怀孕6个月后子宫逐渐增大，也会压迫血管，使得下半身的血液发生淤血，而诱发痔疮，恶化时则可能引起脱肛，因为担心痔疮会恶化，常常强忍便意，而使便秘加重。
另外，随着宝宝的发育，胀大的子宫对排便肌肉的压迫，盆底肌肉群因以往妊娠或胎头、子宫压迫直肠而弱化，造成胃肠的蠕动频率减弱。而且排便需要腹肌的力量协助，在腹部增大后腹肌的力量却在逐渐减弱，因此造成了排便困难。
便秘会增加准妈妈体内毒素，导致机体新陈代谢紊乱、内分泌失调及微量元素不均衡，从而出现皮肤色素沉着、瘙痒、面色无华、毛发枯干，并产生斑点等。还会引起轻度毒血症症状，如食欲减退、精神萎靡、头晕乏力，久之又会导致贫血和营养不良。对宝宝的发育很不利。经常排便用力，还会促使痔疮的形成。并且会使乳房组织细胞发育异常。
便秘是孕期最常见的烦恼之一，也是孕期经常疏忽之处。然而，千万别小看这些习以为常的小毛病，一不留神它就会让你悔恨终身。妊娠晚期，便秘会愈来愈严重，常常几天没有大便，甚至1～2周都未能排便，从而导致准妈妈腹痛、腹胀。严重者可导致肠梗阻，并发早产，危及母婴安危。曾有患者在妊娠38周时因便秘、肠梗阻导致小肠坏死而切除大部分小肠。有的便秘准妈妈分娩时，堆积在肠管中的粪便妨碍宝宝下降，引起产程延长甚至难产。
治疗孕期便秘也要小心，不恰当的治疗也会对宝宝造成伤害。准妈妈们属于特殊的群体，在治疗便秘时，不要口服润滑性的泻药，如蓖麻油、液体石蜡等，这样影响肠道对营养成分的吸收，宝宝的营养得不到很好的保障。而服用导泻剂或者强刺激作用的润肠剂，会使胃肠蠕动增强引起子宫收缩，导致流产或早产。润滑性泻剂(液体石蜡)，减少准妈妈对脂溶性维生素(A、D、E、K)的吸收，使新生宝宝易发生低凝血酶无血症(因缺乏维生素K)而致出血。