新生儿的胃部，从正面看是横躺着的，呈不稳定状态，同时贲门部位（胃部入口）还比较松。由于婴儿的胃贲门部位还不能很好地进行收缩，从而导致进入胃部的奶汁等能比较容易地流回食道。另外，与大人相比，新生儿的喉头位置要高一些，再加上他们含乳头的方式比较笨拙，从而导致吃奶时空气容易与奶汁一起吸入胃部，所以当孩子打嗝或身体晃动时，吃进去的奶也就比较容易被吐出来了。
如果宝宝不是呛咳，那么引起咳嗽吐奶的原因可能如下几种：
1、婴儿的咽喉部位是非常敏感的，任何的刺激包括冷空气等，都会使气管开口处的软组织有肿、胀及痒的异常感觉，为了能局部搔痒，就只有以咳嗽的气流来“抚摸”痒处了，因此婴儿会咳嗽。
2、感染性咳嗽：所处环境中，有人患呼吸系统疾病或环境污染，导致感染，宝宝感冒吃奶是不断咳嗽。
3、过敏性变态反应：如支气管哮喘。
4、胸膜炎。
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