治疗小儿营养不良，首先是调整饮食，轻、重度营养不良患儿，因消化能力尚好，可给予容易消化的食物，并供给大量维生素类，尽可能使糖、脂肪和蛋白质的比例符合3：2：1，每日每公斤体重供给热量170～250焦耳。若消化与吸收良好，每隔两三天酌情适当增加。其次是给患儿服各种消化酶，如胃蛋白酶、胰酶，帮助消化。口服维生素B1、B6与C等。中医推拿捏脊疗法也有一定疗效。极重度营养不良者应住院治疗。
预防婴幼儿营养不良症，主要从新生儿开始进行科学喂养。婴儿期尽量采取母乳喂养，特别是早产儿更应设法母乳喂养。母乳不足可采用人工喂养或混合喂养，并按时添加辅助食品。为婴幼儿制定科学生活制度，纠正不良的生活习惯，保证有充足的睡眠时间，进行合理的室外活动，锻炼身体。这样，能促进食欲，有助于消化能力的提高。对患儿患有其他慢性疾病的，应积极给予治疗，消除病因后，营养不良的情况会得到改善。